Protein–RNA interactions for Protein: O75167

PHACTR2, Phosphatase and actin regulator 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHACTR2O75167 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR2O75167 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR2O75167 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR2O75167 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR2O75167 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR2O75167 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR2O75167 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR2O75167 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR2O75167 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PHACTR2O75167 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
PHACTR2O75167 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PHACTR2O75167 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms