Protein–RNA interactions for Protein: O43759

SYNGR1, Synaptogyrin-1, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNGR1O43759 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SYNGR1O43759 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNGR1O43759 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms