Protein–RNA interactions for Protein: O43716

GATC, Glutamyl-tRNA(Gln) amidotransferase subunit C, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATCO43716 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GATCO43716 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GATCO43716 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GATCO43716 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GATCO43716 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
GATCO43716 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GATCO43716 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms