Protein–RNA interactions for Protein: O43707

ACTN4, Alpha-actinin-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN4O43707 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
ACTN4O43707 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.68■■□□□ 1.38
ACTN4O43707 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms