Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 ARL6IP4-206ENST00000413381 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 512.81□□□□□ -0.366e-10■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.724e-9■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 ZBTB7B-204ENST00000461530 658 ntTSL 418.55■□□□□ 0.563e-6■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 ZBTB7B-205ENST00000483226 243 ntTSL 315.85■□□□□ 0.133e-6■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PPM1G-202ENST00000472077 3752 ntTSL 29.66□□□□□ -0.864e-9■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 PLCXD1-205ENST00000429181 469 ntTSL 414.2□□□□□ -0.143e-10■■■■□ 22.7
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-209ENST00000518437 240 ntTSL 216.65■□□□□ 0.261e-8■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.181e-8■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-203ENST00000469846 670 ntTSL 310.69□□□□□ -0.71e-8■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-205ENST00000481221 683 ntTSL 3 BASIC8□□□□□ -1.131e-8■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-210ENST00000519043 1115 ntTSL 3 BASIC5.48□□□□□ -1.531e-8■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-215ENST00000521609 793 ntTSL 5 BASIC5.27□□□□□ -1.571e-8■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-218ENST00000522525 1867 ntTSL 1 (best)5.19□□□□□ -1.581e-8■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-201ENST00000467069 667 ntTSL 54.97□□□□□ -1.611e-8■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-216ENST00000521708 549 ntTSL 33.76□□□□□ -1.811e-8■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 THUMPD3-AS1-207ENST00000494680 544 ntTSL 53.65□□□□□ -1.831e-8■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 TET3-202ENST00000409262 11388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.846e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.694e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.64e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-214ENST00000581418 580 ntTSL 217.52■□□□□ 0.44e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.364e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.314e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-224ENST00000584460 1855 ntTSL 216.92■□□□□ 0.34e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.194e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-207ENST00000578392 552 ntTSL 415.64■□□□□ 0.094e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-213ENST00000580723 594 ntTSL 415.61■□□□□ 0.094e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-211ENST00000580627 543 ntTSL 414.99□□□□□ -0.014e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-210ENST00000580141 924 ntTSL 514.86□□□□□ -0.034e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-219ENST00000583641 795 ntTSL 214.49□□□□□ -0.094e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-215ENST00000581578 470 ntTSL 412.4□□□□□ -0.424e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPS1-220ENST00000583885 594 ntTSL 411.53□□□□□ -0.564e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 TBCB-208ENST00000588385 776 ntTSL 1 (best)20.72■□□□□ 0.916e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.816e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.296e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 TBCB-206ENST00000585910 656 ntTSL 215.44■□□□□ 0.066e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.046e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 TBCB-207ENST00000586868 466 ntTSL 3 BASIC10.81□□□□□ -0.686e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 SEC24B-202ENST00000399100 3780 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.186e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 SEC24B-201ENST00000265175 5083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.316e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 SEC24B-203ENST00000504968 4066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.426e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 CTTN-206ENST00000482755 1087 ntTSL 218.57■□□□□ 0.565e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 CTTN-211ENST00000527622 597 ntTSL 417.86■□□□□ 0.455e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.944e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.724e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 MBOAT7-214ENST00000495968 465 ntTSL 524.53■■□□□ 1.524e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.194e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 FAH-208ENST00000558767 2087 ntTSL 222.48■■□□□ 1.194e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.114e-7■■■■□ 22.6
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PRPF4O43172 FAH-203ENST00000537726 1396 ntTSL 219.1■□□□□ 0.654e-7■■■■□ 22.6
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PRPF4O43172 SOAT2-202ENST00000542365 1797 ntTSL 218.12■□□□□ 0.494e-7■■■■□ 22.6
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PRPF4O43172 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.374e-7■■■■□ 22.6
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PRPF4O43172 SCAP-210ENST00000468965 570 ntTSL 212.62□□□□□ -0.394e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 KIZ-210ENST00000619189 2130 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.674e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 EPPK1-202ENST00000615648 16002 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.744e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 TPD52-219ENST00000521561 570 ntTSL 49.32□□□□□ -0.924e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 ZBTB18-202ENST00000622512 3740 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC8.82□□□□□ -16e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 LBR-201ENST00000272163 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.04□□□□□ -1.124e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 KIZ-207ENST00000616679 3856 ntAPPRIS ALT2 TSL 57.91□□□□□ -1.144e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 LBR-204ENST00000424022 478 ntTSL 36.04□□□□□ -1.444e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 LBR-202ENST00000338179 3812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.05□□□□□ -1.764e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 KIZ-209ENST00000619179 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 54.02□□□□□ -1.774e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 SSBP4-215ENST00000625926 162 ntTSL 5 BASIC10.33□□□□□ -0.762e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 PLXND1-209ENST00000505505 559 ntTSL 215.88■□□□□ 0.131e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 ZNF407-201ENST00000299687 7948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.311e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 OPLAH-201ENST00000527993 635 ntTSL 521.29■■□□□ 15e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 OPLAH-202ENST00000531027 500 ntTSL 213.56□□□□□ -0.245e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 STAT6-225ENST00000640254 2037 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.215e-12■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 STAT6-218ENST00000555641 1804 ntTSL 516.16■□□□□ 0.185e-12■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 STAT6-205ENST00000543873 3119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.41□□□□□ -0.425e-12■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.66e-7■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.143e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 ZFAND5-203ENST00000376956 690 ntTSL 519.55■□□□□ 0.723e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 ZFAND5-207ENST00000487330 631 ntTSL 217.03■□□□□ 0.323e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.263e-6■■■■□ 22.6
PRPF4O43172 DDR1-279ENST00000515529 340 ntTSL 424.74■■□□□ 1.552e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-255ENST00000504927 542 ntTSL 419.7■□□□□ 0.742e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-259ENST00000507046 573 ntTSL 418.94■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-265ENST00000509639 615 ntTSL 418.94■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-266ENST00000511510 547 ntTSL 518.93■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-274ENST00000513749 584 ntTSL 518.93■□□□□ 0.622e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-280ENST00000515881 956 ntTSL 318.62■□□□□ 0.572e-6■■■■□ 22.5
PRPF4O43172 DDR1-241ENST00000460944 1248 ntTSL 517.54■□□□□ 0.42e-6■■■■□ 22.5
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