Protein–RNA interactions for Protein: O00116

AGPS, Alkyldihydroxyacetonephosphate synthase, peroxisomal, humanhuman

Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGPSO00116 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
AGPSO00116 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
AGPSO00116 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGPSO00116 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGPSO00116 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGPSO00116 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGPSO00116 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGPSO00116 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGPSO00116 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGPSO00116 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
AGPSO00116 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 FAM189B-201ENST00000350210 2379 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
AGPSO00116 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
AGPSO00116 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
AGPSO00116 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGPSO00116 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGPSO00116 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGPSO00116 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGPSO00116 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGPSO00116 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGPSO00116 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGPSO00116 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGPSO00116 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGPSO00116 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
AGPSO00116 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
AGPSO00116 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
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