Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
MCRIP1C9JLW8 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 NKX2-5-201ENST00000329198 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
MCRIP1C9JLW8 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms