Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
USP17L13C9JLJ4 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
USP17L13C9JLJ4 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms