Protein–RNA interactions for Protein: A8MYB1

TMCO5B, Transmembrane and coiled-coil domain-containing protein 5B, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMCO5BA8MYB1 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
TMCO5BA8MYB1 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 RHOBTB3-201ENST00000379982 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TMCO5BA8MYB1 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms