Protein–RNA interactions for Protein: A8MTQ0

NOTO, Homeobox protein notochord, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOTOA8MTQ0 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 SYNC-201ENST00000373484 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
NOTOA8MTQ0 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms