Protein–RNA interactions for Protein: Q15427

SF3B4, Splicing factor 3B subunit 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 424 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B4Q15427 KTN1-213ENST00000554306 476 ntTSL 35.98□□□□□ -1.457e-8■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 KTN1-216ENST00000554570 521 ntTSL 54.46□□□□□ -1.77e-8■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SSR1-207ENST00000479485 640 ntTSL 24.38□□□□□ -1.714e-12■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC2.25□□□□□ -2.051e-323■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 HDAC4-203ENST00000445704 445 ntTSL 316.97■□□□□ 0.311e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 HDAC4-217ENST00000553145 552 ntTSL 416.97■□□□□ 0.311e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 CDHR2-207ENST00000513031 849 ntTSL 313.16□□□□□ -0.31e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 CDHR2-204ENST00000508085 577 ntTSL 212.46□□□□□ -0.411e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 HDAC4-207ENST00000461113 1019 ntTSL 1 (best)11.37□□□□□ -0.591e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 RHOT2-223ENST00000569706 588 ntTSL 321.65■■□□□ 1.061e-8■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 RHBDF2-206ENST00000589582 1726 ntTSL 516.01■□□□□ 0.152e-8■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 RHBDF2-207ENST00000590168 2665 ntTSL 1 (best)13.48□□□□□ -0.252e-8■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 RHBDF2-201ENST00000313080 3582 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.572e-8■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 RHBDF2-215ENST00000591885 3599 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.632e-8■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 CNOT2-215ENST00000548863 737 ntTSL 34.59□□□□□ -1.675e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 MOV10-215ENST00000494319 720 ntTSL 29.36□□□□□ -0.911e-12■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 GALNT12-202ENST00000470473 772 ntTSL 25.53□□□□□ -1.522e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 METAP2-203ENST00000535095 2431 ntTSL 215.16■□□□□ 0.022e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.352e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 METAP2-209ENST00000550777 1779 ntTSL 5 BASIC11.14□□□□□ -0.632e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 METAP2-201ENST00000261220 1836 ntTSL 2 BASIC10.84□□□□□ -0.672e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 METAP2-210ENST00000551840 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.13□□□□□ -0.952e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 METAP2-202ENST00000323666 3601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.62□□□□□ -1.032e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 RPL7A-208ENST00000492798 374 ntTSL 1 (best)5.75□□□□□ -1.491e-323■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SNORD36C-201ENST00000516733 66 ntBASIC1.47□□□□□ -2.171e-323■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 PPP1R2-203ENST00000438848 839 ntTSL 515.04■□□□□ -02e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 PPP1R2-206ENST00000618156 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.742e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 PPP1R2-201ENST00000413183 706 ntTSL 510.11□□□□□ -0.792e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 PPP1R2-202ENST00000418939 872 ntTSL 34.12□□□□□ -1.752e-7■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SLC38A2-213ENST00000553252 846 ntTSL 215.36■□□□□ 0.051e-17■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 HAUS5-207ENST00000588570 553 ntTSL 419.76■□□□□ 0.753e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.483e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 CENPU-205ENST00000510146 1549 ntTSL 1 (best)18■□□□□ 0.473e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SENP2-206ENST00000453532 829 ntTSL 517.39■□□□□ 0.373e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.353e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.323e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 UNKL-206ENST00000402641 669 ntTSL 316.83■□□□□ 0.283e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 POLD2-211ENST00000464871 580 ntTSL 316.78■□□□□ 0.286e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 HAUS5-209ENST00000592291 526 ntTSL 315.26■□□□□ 0.033e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 HK1-209ENST00000470050 314 ntTSL 515.04■□□□□ -03e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 FECH-204ENST00000585699 512 ntTSL 414.91□□□□□ -0.026e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 NDE1-205ENST00000572756 915 ntTSL 514.63□□□□□ -0.073e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SENP2-202ENST00000413407 2383 ntTSL 213.98□□□□□ -0.173e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 CENPU-206ENST00000514781 688 ntAPPRIS ALT2 TSL 313.9□□□□□ -0.183e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 UNKL-214ENST00000515195 481 ntTSL 413.59□□□□□ -0.233e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 ENY2-206ENST00000518584 566 ntTSL 212.94□□□□□ -0.346e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 USO1-201ENST00000264904 4135 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.343e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 UNKL-213ENST00000513783 582 ntTSL 412.85□□□□□ -0.353e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 RAB8A-203ENST00000587156 554 ntTSL 212.59□□□□□ -0.393e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 PCSK6-204ENST00000558154 852 ntTSL 211.82□□□□□ -0.523e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 AKT2-233ENST00000578975 3337 nt11.67□□□□□ -0.543e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SENP2-203ENST00000430355 878 ntTSL 511.52□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 PCSK6-219ENST00000621185 462 ntTSL 211.47□□□□□ -0.573e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 RAB8A-205ENST00000589697 1754 ntTSL 1 (best)11.19□□□□□ -0.623e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 RAB8A-202ENST00000586682 1315 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 USO1-204ENST00000514213 4034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.633e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 FANCA-210ENST00000563318 605 ntTSL 511.06□□□□□ -0.643e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SLC25A40-203ENST00000444363 702 ntTSL 310.3□□□□□ -0.763e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SLC25A40-207ENST00000491499 499 ntTSL 310.3□□□□□ -0.763e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 FECH-207ENST00000591215 590 ntTSL 59.99□□□□□ -0.816e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 PI4KA-212ENST00000484220 646 ntTSL 39.63□□□□□ -0.873e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 ENY2-207ENST00000519754 561 ntTSL 49.5□□□□□ -0.896e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 NDE1-201ENST00000396354 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.983e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 NDE1-210ENST00000574163 352 ntTSL 38.89□□□□□ -0.993e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 HNRNPUL1-217ENST00000600596 581 ntTSL 58.86□□□□□ -0.993e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 NDE1-202ENST00000396355 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.71□□□□□ -1.013e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 NDE1-212ENST00000577101 575 ntTSL 48.69□□□□□ -1.023e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 NDE1-207ENST00000573203 762 ntTSL 38.26□□□□□ -1.093e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SENP2-210ENST00000473760 738 ntTSL 28.22□□□□□ -1.093e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 PSMD6-203ENST00000463139 2621 ntTSL 28.19□□□□□ -1.13e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 FXR1-216ENST00000482125 739 ntTSL 57.86□□□□□ -1.156e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SUPT6H-208ENST00000583340 581 ntTSL 37.86□□□□□ -1.153e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SLC25A40-201ENST00000341119 4045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.82□□□□□ -1.323e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 AFF4-207ENST00000477369 728 ntTSL 56.36□□□□□ -1.396e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 OSBPL9-224ENST00000533825 565 ntTSL 45.98□□□□□ -1.451e-11■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 ZFAND1-218ENST00000522032 784 ntTSL 35.53□□□□□ -1.523e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 MPHOSPH9-214ENST00000541823 586 ntTSL 45.53□□□□□ -1.523e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SEC63-210ENST00000489455 444 ntTSL 55.39□□□□□ -1.556e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 TJP2-207ENST00000498204 643 ntTSL 25.31□□□□□ -1.563e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 AFF4-202ENST00000378593 430 ntTSL 54.68□□□□□ -1.666e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 AFF4-205ENST00000425658 513 ntTSL 54.64□□□□□ -1.676e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 ZC3H14-216ENST00000556000 2092 ntTSL 1 (best)4.5□□□□□ -1.693e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SLC25A40-202ENST00000429674 1077 ntTSL 34.24□□□□□ -1.733e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 HNRNPLL-208ENST00000441689 512 ntTSL 34.21□□□□□ -1.746e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SENP2-208ENST00000459883 525 ntTSL 42.91□□□□□ -1.943e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 MAPK14-207ENST00000490379 450 ntTSL 32.85□□□□□ -1.956e-9■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 FAM102B-203ENST00000483371 8333 ntTSL 22.31□□□□□ -2.043e-6■□□□□ 9.3
SF3B4Q15427 SNORD89-201ENST00000390981 114 ntBASIC0.86□□□□□ -2.273e-33■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 INSIG1-204ENST00000425172 596 ntTSL 221.89■■□□□ 1.091e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 FKBP8-203ENST00000594844 593 ntTSL 419.22■□□□□ 0.671e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 FKBP8-207ENST00000597547 574 ntTSL 315.23■□□□□ 0.031e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 FKBP8-208ENST00000597611 966 ntTSL 313.95□□□□□ -0.181e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 ANP32A-204ENST00000480858 352 ntTSL 1 (best)13.61□□□□□ -0.231e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC12.34□□□□□ -0.432e-12■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 FKBP8-210ENST00000599540 1140 ntTSL 212.05□□□□□ -0.481e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 PHKG2-203ENST00000561712 621 ntTSL 37.93□□□□□ -1.141e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 FKBP8-214ENST00000609656 220 ntTSL 25.86□□□□□ -1.471e-8■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 WDR18-208ENST00000591276 607 ntTSL 313.95□□□□□ -0.183e-6■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 ITGB1-213ENST00000484088 580 ntTSL 42.21□□□□□ -2.063e-10■□□□□ 9.2
SF3B4Q15427 CDC34-205ENST00000606065 1062 ntTSL 520.35■□□□□ 0.852e-7■□□□□ 9.2
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