Protein–RNA interactions for Protein: Q15029

EFTUD2, 116 kDa U5 small nuclear ribonucleoprotein component, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 972 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFTUD2Q15029 CYBRD1-206ENST00000474182 465 ntTSL 514.16□□□□□ -0.145e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.155e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.165e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-210ENST00000532423 507 ntTSL 213.67□□□□□ -0.225e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-209ENST00000530868 650 ntTSL 313.03□□□□□ -0.325e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CYBRD1-202ENST00000375252 3540 ntTSL 1 (best) BASIC12.22□□□□□ -0.455e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TTK-208ENST00000509894 3725 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.475e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-206ENST00000524679 915 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.595e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 HIPK1-202ENST00000361587 5766 ntTSL 1 (best)11.31□□□□□ -0.65e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 RBM5-207ENST00000438369 560 ntTSL 411.31□□□□□ -0.65e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 LARP4B-204ENST00000440895 656 ntTSL 211.11□□□□□ -0.635e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 LARP4B-209ENST00000608970 656 ntTSL 211.11□□□□□ -0.635e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CYBRD1-201ENST00000321348 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.725e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TEC-201ENST00000381501 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.735e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TPD52L1-204ENST00000392482 1165 ntTSL 2 BASIC10.45□□□□□ -0.745e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 RBM5-208ENST00000441305 569 ntTSL 39.81□□□□□ -0.845e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DDX47-209ENST00000544032 1044 ntTSL 29.63□□□□□ -0.875e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 SRPRA-207ENST00000532268 829 ntTSL 29.51□□□□□ -0.895e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DDX47-208ENST00000542832 554 ntTSL 58.71□□□□□ -1.025e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TEC-204ENST00000511471 814 ntTSL 58.66□□□□□ -1.025e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TEC-205ENST00000515146 681 ntTSL 38.56□□□□□ -1.045e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 MPP1-213ENST00000482757 989 ntTSL 28.13□□□□□ -1.115e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 DDX47-204ENST00000426619 531 ntTSL 48.06□□□□□ -1.125e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TEC-202ENST00000505452 2446 ntTSL 57.71□□□□□ -1.175e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 BAG1-206ENST00000473464 551 ntTSL 56.57□□□□□ -1.365e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 MPP1-216ENST00000491955 2378 ntTSL 26.46□□□□□ -1.385e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CDCA3-209ENST00000544610 624 ntTSL 36.43□□□□□ -1.385e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 CYBRD1-203ENST00000409484 1493 ntTSL 2 BASIC6.02□□□□□ -1.455e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 ZNF292-205ENST00000466062 838 ntTSL 55.98□□□□□ -1.455e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 AZIN1-210ENST00000523071 839 ntTSL 35.01□□□□□ -1.615e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TTK-210ENST00000515751 584 ntTSL 44.36□□□□□ -1.715e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 AZIN1-208ENST00000521536 680 ntTSL 54.16□□□□□ -1.745e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.19□□□□□ -2.065e-8■□□□□ 10.4
EFTUD2Q15029 RSRC2-216ENST00000528279 562 ntTSL 411.03□□□□□ -0.641e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 RSRC2-209ENST00000525570 553 ntTSL 410.44□□□□□ -0.741e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 RBMX-206ENST00000561733 837 ntTSL 310.18□□□□□ -0.784e-11■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 RBMX-205ENST00000496459 2041 ntTSL 26.23□□□□□ -1.414e-11■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 SND1-214ENST00000489417 1447 ntTSL 221.02■□□□□ 0.965e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 SND1-212ENST00000485871 597 ntTSL 311.34□□□□□ -0.595e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 FKBP10-207ENST00000490938 837 ntTSL 215.02■□□□□ -05e-19■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.717e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.477e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 TTC19-210ENST00000583704 552 ntTSL 220.92■□□□□ 0.947e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 HGFAC-202ENST00000506132 743 ntTSL 217.8■□□□□ 0.447e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 STARD3-210ENST00000577248 571 ntTSL 417.42■□□□□ 0.387e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 ACAP3-207ENST00000470659 421 ntTSL 316.15■□□□□ 0.187e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 AHCTF1-205ENST00000478568 611 ntTSL 415.91■□□□□ 0.147e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 STARD3-228ENST00000585214 566 ntTSL 415.62■□□□□ 0.097e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 STARD3-222ENST00000583419 579 ntTSL 414.97□□□□□ -0.017e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 TPT1-AS1-204ENST00000434849 2369 ntTSL 214.69□□□□□ -0.067e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 ERCC3-205ENST00000460485 815 ntTSL 314.42□□□□□ -0.17e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 LIMK2-205ENST00000425203 606 ntTSL 1 (best)13.91□□□□□ -0.187e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 HM13-208ENST00000464508 855 ntTSL 213.36□□□□□ -0.277e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 HM13-216ENST00000479096 598 ntTSL 311.61□□□□□ -0.557e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 KHNYN-203ENST00000554268 760 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.78e-17■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 TPT1-AS1-218ENST00000523445 856 ntTSL 5 BASIC9.88□□□□□ -0.837e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 ERCC3-204ENST00000456257 563 ntTSL 47.57□□□□□ -1.27e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 TPT1-AS1-214ENST00000521507 665 ntTSL 5 BASIC7.29□□□□□ -1.247e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 TPT1-AS1-216ENST00000522845 403 ntTSL 3 BASIC3.58□□□□□ -1.847e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 NDC80-204ENST00000575515 553 ntTSL 59.9□□□□□ -0.829e-7■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 NDC80-201ENST00000261597 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.77□□□□□ -1.339e-7■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 RPS6-202ENST00000380381 892 ntTSL 2 BASIC9.26□□□□□ -0.933e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 PKD1P6-203ENST00000538100 705 ntTSL 319.78■□□□□ 0.768e-19■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 SNRPG-207ENST00000480370 487 ntTSL 210.55□□□□□ -0.725e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 SNRPG-203ENST00000429728 566 ntTSL 28.13□□□□□ -1.115e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 SNRPG-201ENST00000272348 625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.26□□□□□ -1.255e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 SNRPG-206ENST00000454893 527 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.855e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 ZNF207-217ENST00000584696 743 ntTSL 25.35□□□□□ -1.552e-19■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 PLEKHA1-206ENST00000463663 617 ntTSL 523.52■■□□□ 1.367e-20■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 PLEKHA1-208ENST00000494222 603 ntTSL 319.42■□□□□ 0.77e-20■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 PLEKHA1-202ENST00000368989 3771 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.667e-20■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 NDRG1-228ENST00000523931 554 ntTSL 39.39□□□□□ -0.911e-10■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 GCKR-202ENST00000411584 789 ntTSL 37.12□□□□□ -1.271e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 PLEKHA1-203ENST00000368990 14010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.97□□□□□ -1.457e-20■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 DDX18-205ENST00000476149 5674 ntTSL 25.55□□□□□ -1.523e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 RBCK1-214ENST00000621487 473 ntTSL 215.05■□□□□ -08e-40■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.123e-8■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.223e-8■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 CLIC1-209ENST00000395892 1197 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.223e-8■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 CLIC1-207ENST00000375780 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.563e-8■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 CLIC1-210ENST00000616760 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.873e-8■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 IFRD1-216ENST00000535603 3397 ntTSL 2 BASIC6.95□□□□□ -1.32e-7■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 IFRD1-211ENST00000466459 555 ntTSL 55.08□□□□□ -1.62e-7■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 IFRD1-214ENST00000486688 567 ntTSL 44.17□□□□□ -1.742e-7■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 IL1R1-211ENST00000442590 577 ntTSL 311.41□□□□□ -0.587e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 IL1R1-212ENST00000450319 549 ntTSL 310.68□□□□□ -0.77e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 IL1R1-213ENST00000452403 609 ntTSL 35.62□□□□□ -1.517e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 ETV4-210ENST00000590236 616 ntTSL 314.7□□□□□ -0.063e-8■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.543e-11■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.313e-11■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 EIF4H-205ENST00000495187 575 ntTSL 39.92□□□□□ -0.823e-12■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.252e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.162e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 MAP4-207ENST00000426837 8920 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.782e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 NGDN-209ENST00000556483 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 55.18□□□□□ -1.581e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 NOP56-205ENST00000462630 859 ntTSL 28.34□□□□□ -1.073e-9■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 HCFC1-204ENST00000461098 379 ntTSL 510.84□□□□□ -0.675e-6■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 DESI1-201ENST00000263256 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.42□□□□□ -0.424e-15■□□□□ 10.3
EFTUD2Q15029 RAB3GAP1-203ENST00000442034 4185 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 10.2
EFTUD2Q15029 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.59□□□□□ -0.872e-6■□□□□ 10.2
Retrieved 100 of 48,698 protein–RNA pairs in 3956 ms