Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N1

COX11, Cytochrome c oxidase assembly protein COX11, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COX11Q9Y6N1 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
COX11Q9Y6N1 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ARL6IP4-210ENST00000453766 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
COX11Q9Y6N1 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms