Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y2

NUBP2, Cytosolic Fe-S cluster assembly factor NUBP2, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUBP2Q9Y5Y2 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
NUBP2Q9Y5Y2 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
NUBP2Q9Y5Y2 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms