Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X0

SNX10, Sorting nexin-10, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX10Q9Y5X0 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 ST3GAL4-201ENST00000227495 1790 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
SNX10Q9Y5X0 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SH2B2-202ENST00000536178 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 RFLNA-201ENST00000324038 2148 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SNX10Q9Y5X0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms