Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y241

HIGD1A, HIG1 domain family member 1A, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIGD1AQ9Y241 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
HIGD1AQ9Y241 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
HIGD1AQ9Y241 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms