Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMQ6

CAPN11, Calpain-11, humanhuman

Predictions only

Length 739 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPN11Q9UMQ6 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 GNB2-209ENST00000436220 1479 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CAPN11Q9UMQ6 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CAPN11Q9UMQ6 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms