Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULB5

CDH7, Cadherin-7, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH7Q9ULB5 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 NABP2-203ENST00000380198 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CDH7Q9ULB5 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
CDH7Q9ULB5 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms