Protein–RNA interactions for Protein: Q9UL16

CFAP45, Cilia- and flagella-associated protein 45, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP45Q9UL16 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 IGHV3-20-201ENST00000390606 415 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CFAP45Q9UL16 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CFAP45Q9UL16 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms