Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CDH22Q9UJ99 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 KLC3-204ENST00000585434 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 SSNA1-201ENST00000322310 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 ZCCHC9-204ENST00000438268 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CDH22Q9UJ99 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms