Protein–RNA interactions for Protein: Q9UIS9

MBD1, Methyl-CpG-binding domain protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 605 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MBD1Q9UIS9 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MBD1Q9UIS9 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms