Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHG2

PCSK1N, ProSAAS, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCSK1NQ9UHG2 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCSK1NQ9UHG2 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCSK1NQ9UHG2 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms