Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHF7

TRPS1, Zinc finger transcription factor Trps1, humanhuman

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1Q9UHF7 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
TRPS1Q9UHF7 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TRPS1Q9UHF7 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms