Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHA2

SS18L2, SS18-like protein 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SS18L2Q9UHA2 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
SS18L2Q9UHA2 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
SS18L2Q9UHA2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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