Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN1

CACNG4, Voltage-dependent calcium channel gamma-4 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG4Q9UBN1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ANKRD19P-205ENST00000473204 2370 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CACNG4Q9UBN1 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
CACNG4Q9UBN1 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms