Protein–RNA interactions for Protein: Q9P2B4

CTTNBP2NL, CTTNBP2 N-terminal-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2NLQ9P2B4 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF419-203ENST00000354197 1569 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CTTNBP2NLQ9P2B4 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms