Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZD8

SPG21, Maspardin, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPG21Q9NZD8 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SPG21Q9NZD8 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SPG21Q9NZD8 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms