Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ53

PODXL2, Podocalyxin-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 605 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PODXL2Q9NZ53 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 REPIN1-214ENST00000489432 2058 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 RASGRP2-207ENST00000377497 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 GDF6-203ENST00000621429 1179 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 AC066615.1-201ENST00000640911 628 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 SNRK-203ENST00000437827 1995 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 CENPN-201ENST00000299572 1398 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
PODXL2Q9NZ53 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PODXL2Q9NZ53 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms