Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GGA3Q9NZ52 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
GGA3Q9NZ52 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.4 ms