Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 PLEKHF1-204ENST00000592810 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
VNN3Q9NY84 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
VNN3Q9NY84 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms