Protein–RNA interactions for Protein: Q9NW38

FANCL, E3 ubiquitin-protein ligase FANCL, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCLQ9NW38 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 AZIN2-204ENST00000373443 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
FANCLQ9NW38 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 TMCC2-209ENST00000637895 1455 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 FDFT1-210ENST00000525954 1890 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
FANCLQ9NW38 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms