Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVI1

FANCI, Fanconi anemia group I protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCIQ9NVI1 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
FANCIQ9NVI1 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
FANCIQ9NVI1 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms