Protein–RNA interactions for Protein: Q9NV31

IMP3, U3 small nucleolar ribonucleoprotein protein IMP3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IMP3Q9NV31 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ST3GAL4-215ENST00000532243 1825 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
IMP3Q9NV31 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 PHLDB2-210ENST00000478922 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
IMP3Q9NV31 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.1 ms