Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRW1

RAB6B, Ras-related protein Rab-6B, humanhuman

Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6BQ9NRW1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
RAB6BQ9NRW1 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB6BQ9NRW1 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms