Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRL3

STRN4, Striatin-4, humanhuman

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRN4Q9NRL3 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
STRN4Q9NRL3 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
STRN4Q9NRL3 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
STRN4Q9NRL3 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms