Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRG4

SMYD2, N-lysine methyltransferase SMYD2, humanhuman

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMYD2Q9NRG4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SOX12-201ENST00000342665 4630 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SYT6-210ENST00000641643 1587 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 WT1-210ENST00000639563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
SMYD2Q9NRG4 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
SMYD2Q9NRG4 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.9 ms