Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRF2

SH2B1, SH2B adapter protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH2B1Q9NRF2 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SH2B1Q9NRF2 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SH2B1Q9NRF2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms