Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ35

NRIP3, Nuclear receptor-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRIP3Q9NQ35 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 FOSL1-201ENST00000312562 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TUSC3-209ENST00000509380 1266 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AC126544.1-201ENST00000580842 1059 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
NRIP3Q9NQ35 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms