Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 BMP1-204ENST00000397814 836 ntTSL 4 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 PARD6A-203ENST00000602551 1171 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
FZD3Q9NPG1 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
FZD3Q9NPG1 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms