Protein–RNA interactions for Protein: Q9H875

PRKRIP1, PRKR-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKRIP1Q9H875 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
PRKRIP1Q9H875 IFNGR2-203ENST00000405436 1684 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PRKRIP1Q9H875 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
PRKRIP1Q9H875 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms