Protein–RNA interactions for Protein: Q9H7F0

ATP13A3, Probable cation-transporting ATPase 13A3, humanhuman

Predictions only

Length 1,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP13A3Q9H7F0 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
ATP13A3Q9H7F0 CDKN1C-204ENST00000440480 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP13A3Q9H7F0 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.45■■□□□ 1.03
ATP13A3Q9H7F0 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC106738.1-201ENST00000560487 359 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 GMPPA-201ENST00000313597 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.02
ATP13A3Q9H7F0 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 AP001160.3-201ENST00000601484 763 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
ATP13A3Q9H7F0 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms