Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4D0

CLSTN2, Calsyntenin-2, humanhuman

Predictions only

Length 955 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN2Q9H4D0 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 B4GAT1-201ENST00000311181 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CLSTN2Q9H4D0 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 TMPO-204ENST00000393053 2374 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
CLSTN2Q9H4D0 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms