Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2S6

TNMD, Tenomodulin, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNMDQ9H2S6 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 SAXO1-201ENST00000380530 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 AC087239.1-201ENST00000622671 572 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 NPNT-204ENST00000453617 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TNMDQ9H2S6 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TNMDQ9H2S6 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms