Protein–RNA interactions for Protein: Q9H009

NACA2, Nascent polypeptide-associated complex subunit alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NACA2Q9H009 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 B4GALNT1-202ENST00000418555 1861 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 MEIS3-202ENST00000441740 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NACA2Q9H009 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NACA2Q9H009 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 126.8 ms