Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0J9

BHLHE41, Class E basic helix-loop-helix protein 41, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHE41Q9C0J9 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 CBWD6-201ENST00000377391 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
BHLHE41Q9C0J9 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
BHLHE41Q9C0J9 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms