Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZR9

TRIM8, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIM8, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM8Q9BZR9 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 INPP1-201ENST00000322522 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TRIM8Q9BZR9 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 FAM185A-201ENST00000409231 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 DECR2-201ENST00000219481 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PDLIM3-203ENST00000284771 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 ALDH6A1-201ENST00000350259 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
TRIM8Q9BZR9 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms