Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY12

SCAPER, S phase cyclin A-associated protein in the endoplasmic reticulum, humanhuman

Predictions only

Length 1,400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCAPERQ9BY12 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
SCAPERQ9BY12 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 KCTD13-202ENST00000561540 1773 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SCAPERQ9BY12 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SCAPERQ9BY12 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms