Protein–RNA interactions for Protein: Q99952

PTPN18, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 18, humanhuman

Predictions only

Length 460 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN18Q99952 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 GNB2-201ENST00000303210 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
PTPN18Q99952 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PTPN18Q99952 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms