Protein–RNA interactions for Protein: Q96ST3

SIN3A, Paired amphipathic helix protein Sin3a, humanhuman

Predictions only

Length 1,273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3AQ96ST3 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 COX20-201ENST00000366528 568 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC30.89■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
SIN3AQ96ST3 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC30.88■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC30.86■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC30.86■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC30.84■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
SIN3AQ96ST3 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms