Protein–RNA interactions for Protein: Q96RY5

CRAMP1, Protein cramped-like, humanhuman

Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRAMP1Q96RY5 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRAMP1Q96RY5 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRAMP1Q96RY5 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
CRAMP1Q96RY5 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 MDK-205ENST00000405308 1166 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CRAMP1Q96RY5 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CRAMP1Q96RY5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms